Lembaga Desa

 1. Pemerintah Desa Naekake A

No	N a m a	Jabatan	Pendidikan Terakhir
1	Milikhior kebo	Kepala Desa	SLTP
2	Marianus N. Obe	Sekretaris Desa	SLTA
3	Eduardus Melky Kuil	Kuar PDE	SLTA
4	Kristis Thomas Eko	Kaur Pemerintahan	SLTA
5	Oktofianus Naif	Kaur Umum & Keuangan	SLTA
6	Salvinus Eko	Kasei Pembangunan	SLTA
7	Petrus Falo	Kasie Trantip	SLTP
8	Mersiana F. Nanis	Kasie Kesos	SLTA
9	Jonisius Efi	Kadus A	SLTP
10	Bernabas Elu	Kadus B	SLTP
11	Agustinus Bais	Kadus C	SLTP
12	Ignasius Kefi	Kadus C	SLTP

2. Badan Permusyawaratan Desa ( BPD )

No	N a m a	Jabatan	Pendidikan Terakhir
1	Robertus B. Obe, SP	Ketua	S1
2	Andreas Tamelab	Wakil Ketua	SLTP
3	Bertha Efi, A. Md. Keb	Sekretaris	D 3
4	Fitus Tob, S.Pd	Anggota	S1
5	Yokobus Sila	Anggota	SLTP
6	Regoinda Elu	Anggota	SLTA
7	Yohanes Bani	Anggota	SLTA

3. Lembaga Kemasyarakatan

Lembaga Kemasyarakatan Musyawarah Desa ( LKMD ), terdiri dari :

No	N a m a	Jabatan	Pendidikan Terakhir
1	Yulianus Pao Elu	Ketua I	SD
2	Laurensius falo	Sekretaris	SD
3	Lambertus Eko	Bendahara	SD
4	Yasintus Kenat	Sesksi P4	SD
5	Krisisthomas Y. N. Tamelab	Seksi Pendidikan	SD
6	Silvester Sila	Seksi Agama	SD
7	Filipus Tefa	Seksi Keamanan	SD
8	Bertha Efi	Seksi Kesehatan	SD
9	Romandus Obe	Seksi Lingkup	SD
10	Afelinda M. Obe	Seksi Kesenian	SD
11	Ema Eko	Seksi PKK	SD
12	Pertus Kolo	Pem.& Olah raga	SLTA

4. Lembaga PKK

No	N a m a	Jabatan	Pendidikan Terakhir
1	Ema Eko	Ketua	SD
2	Maria Goreti Elu	Wakil Ketua	SLTA
3	Balbina Anunut	Bendahara	SD
4	Avelinda M. Obe	Sekretaris	SLTA
5	Vensiana Sila	Pokja I	SD
6	Ana Tob	Pokja II	SD
7	Yulita Hali	Pokja III	SLTA
8	Bertha Efi	Pokja IV	D3

5.Lembaga RT

Lembaga RT sesuai Dasar Hukum pembentukan yang ada di Desa Naekake A berjumlah 23 (dua puluh tiga) RT dengan jumlah pengurus yang menyebar di 4 (empat) wilayah Dusun dengan jumlah penduduk 1.581  jiwa.